Проблему удалось решить, не совсем правда понятно, что именно не работало.
Я прочитал, что проблема может быть в esptool (я на линуксе сижу).
С esp-open-sdk шел esptool вот этой версии:
Я поменял версию на esptool 1.1 и прошил чип ей, перезагрузок больше не было, потом я вернулся для теста на...