Очевидно, что выход где TX, то есть передача. Кстати ТХ от Atmega должен идти к RX ESP8266, хоть и можно их местами поменять, но как-то привычнее так.
Кстати, почему схема плохая, ведь внутренняя защита есть, а польза от резистора в том, что резистор ограничит ток и не приведет к перегрузке...