У меня тоже самое. С IDE 1.6.1 та которая с https://github.com/esp8266/Arduino/releases все работает, грузиться и запускается, а если ставить с https://ci.appveyor.com/project/igrr/Arduino/build/artifacts то загружается, но не запускается. и код получается на 10% больше.
Я об этом писал выше...