Не, в режим загрузчика оно не входило, т.к. прошивка работала, DS3231 опрашивался, но вместо результатов шёл мусор. Такое впечатление что именно RTC не хочет работать с пинами GPIO 0,2. Находил инфу что датчик давления bmp180 на них работает. Причём то-ли на SDA-0, SCL-2 - работает, а на 2,0...