нет, метод Прони как и метод Берга как и метод максимума энтропии - это методы для чисто шумовых процессов,
а здесь линейчатый спектр,
поэтому алгоритм БПФ + кое-какие преобразования для устранения систематических(методических) погрешностей
Но это самая простая часть (съел на этом кучу собак)
есть другие более сложные технические и программные вопросы
Но игра стоит свеч.