Не отвечу на всё, я сам сюда прихожу за ответами, но для затравки начну )
Не надо смотреть на статью с ESP-01, это древность. Используйте ESP-12, он много лучше.
Что касается "pwn" (видимо, имелся в виду pwm?), их у ESP-12 четыре штуки.
Общаться с ATmega, конечно, сможет. Через другую ESP-12 по...