немного уточню. Если будете создавать функцию save(), то её и вставляйте в обработчик. Сейчас у вас есть srv_handle_set, можете как показали
server.on("/save", srv_handle_set);
использовать её. В неё и добавляйте сохранение в EEPROM и, в зависимости от результата, формируйте ответ сервера "Ок"...